Фамилия Мотошкина — женская форма, а её мужской вариант Мотошкин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Мотошка. Разобраться с его происхождением помогают сразу два направления: глагол «мотать» и старые русские имена на -ошка.

Самое прямое объяснение — от глагола «мотать» в значении «наматывать, сматывать нитки». Мотошкой могли прозвать того, кто занимался сматыванием пряжи, — работника на ткацком или прядильном производстве. В крестьянском быту мотать пряжу было делом распространённым, и прозвище могло закрепиться за человеком по роду занятий. Но у «мотать» есть и переносный смысл: «тратить без толку, расточать». Мотошкой могли назвать гуляку или кутилу, который быстро спускал нажитое. Второе значение встречается в русских говорах, хотя и реже.

Другой путь — через уменьшительно-ласкательную форму имени. В древнерусском языке суффикс -ошка активно использовался для образования имён: Матвей → Матюшка, Мотя → Мотошка. Это могло быть народное сокращение от Матвей, Модест или даже Моисей. Фамилии на -ин традиционно образовывались от имён и прозвищ с конечным -а/-я, поэтому Мотошкин буквально значит «сын Мотошки».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: такую модель в основном использовали в северных и центральных русских землях. Встречаемость фамилии Мотошкин подтверждается в старых переписях Рязанской и Нижегородской губерний, что косвенно указывает на регионы бытования прозвища. Однокоренные фамилии — Моталов, Моталкин, Мотовилов — все они связаны с тем же глаголом и разными оттенками значения: от ремесла до характера.

Какая из версий вернее — сказать сложно. Но сочетание суффикса -ошка и фамильного -ин типично для прозвищного происхождения: Мотошка как самостоятельное имя-прозвище, данное либо по работе с нитками, либо по мотовству, со временем закрепилось за родом.