Фамилия Муфараджиев — одна из тех, что сразу выдают восточные корни, но при этом её устройство чисто русское по форме. Основа здесь — арабское личное имя Муфарадж (или Муфаррадж), которое означает «тот, кто приносит радость» или «избавитель». В мусульманской традиции такие имена давали с пожеланием, чтобы ребёнок стал утешением для семьи. К имени добавили типичный русский патронимический суффикс -ев, который в фамилиях присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или шипящий. Таким образом, Муфараджиев — это буквально «сын Муфараджа».

Интересна редкость этой фамилии. В отличие от массовых Барановых или Кузнецовых, она встречается точечно, и почти все носители — из регионов с компактным проживанием тюркских или кавказских народов, например, из Дагестана, Чечни или Азербайджана. Это говорит о том, что фамилия не возникла в центральной России, а была принесена в русское языковое пространство относительно поздно, в XIX–XX веках, когда мусульмане империи получали официальные документы с русифицированными окончаниями.

Есть и вторая, менее вероятная версия: что в основе лежит не имя, а прозвище от арабского слова «фарадж» (радость, облегчение) с приставкой «му-», образующей действующее лицо. Тогда Муфараджиев — потомок человека, которого прозвали «радостным» или «утешителем». Но первая версия надёжнее, потому что в ономастике фамилии от личных имён встречаются в разы чаще, чем от прозвищ.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна тем, что сохранила «живой» арабский корень, не адаптировав его в более привычное для русского уха звучание (например, Фараджев). Суффикс -ев здесь не просто грамматический показатель, а маркер того, что фамилия оформлена уже в русской канцелярской традиции. Если бы предок остался в своей среде, его бы звали просто Муфарадж оглы или Муфараджев. Появление именно формы Муфараджиев — результат бюрократической записи, когда чиновник на слух передал мягкое «дж» и закрепил его суффиксом.

Среди известных носителей фамилия не раскручена, но в базах данных встречаются люди с такой фамилией в среде спортсменов и преподавателей, что подтверждает её современное бытование в разных социальных слоях.