Фамилия Мукаиршоев — яркий пример того, как русский суффикс присоединился к восточному имени, создав фамилию, которая режет слух непривычному человеку, но абсолютно логична по своей структуре. Её основа — составное имя Мукаиршо, распространённое у таджиков и афганцев. Первая часть, «Мукаир», скорее всего, восходит к арабскому «мукаййир» — «изменяющий», «преобразующий», в религиозном контексте — «тот, кто меняет веру» или «обновитель». Вторая часть, «шо», — это «шах», то есть «царь», «господин». Таким образом, Мукаиршо дословно означает «царь-преобразователь» или «владыка, меняющий порядок». Имя редкое, но не уникальное для Памира и Горного Бадахшана.

Русский суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Мукаиршоев. Так в XIX–XX веках, при контактах с Российской империей и советской паспортизацией, множество фамилий народов Средней Азии получили стандартное русское оформление. Фамилия Мукаиршоев — не старорусская и не дворянская, а поздняя, искусственная по форме, но естественная по происхождению: её носитель — потомок человека по имени Мукаиршо.

Географически фамилия привязана к Таджикистану, особенно к Горно-Бадахшанской автономной области, где исмаилитские имена с арабскими корнями встречаются часто. В России или других странах СНГ она остаётся крайне редкой, что делает её своеобразным маркером происхождения из памирской общины. В отличие от фамилий на -ов/-ев, образованных от профессий или прозвищ, эта сразу отсылает к личному имени, которое несло в себе пожелание силы и перемен.

Словообразовательная модель проста: корень Мукаиршо + суффикс -ев. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Мукаиршоев, хотя в устной речи возможны варианты. По сути, это типичная «патронимическая» фамилия, где имя отца стало родовым прозванием. Никаких сложных споров о корнях здесь нет — версия с арабским «мукаййир» и персидским «шах» признаётся основной.