Фамилия Мукдаров — редкая и с неочевидной на первый взгляд этимологией. В ней сразу бросается в глаза корень «мукд-», который не встречается в списке распространённых русских прозвищ или имён. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского происхождения, адаптированная русской моделью на -ов.

Основа «Мукдар» могла возникнуть от мусульманского имени Мукдад (араб. «сильный», «могучий»). В тюркских языках, особенно татарском и башкирском, при заимствовании арабских имён часто происходила замена конечного «д» на «р» из-за особенностей произношения. Имя Мукдар в таком виде фиксируется у татар и народов Кавказа. Соответственно, Мукдаров — «сын Мукдара», что типично для фамилий, образованных от имени отца.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная для южных регионов, — связь с арабским словом «мукдир» (مُقْدِر), означающим «способный», «властный», «дающий силу». В этом случае фамилия указывала бы на характер или социальное положение первого носителя, но такая форма встречается реже, чем имя.

С точки зрения географии, фамилия Мукдаров почти не встречается в центральной России. Её можно найти преимущественно в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в Средней Азии. Это подсказывает, что предки носителя фамилии были, скорее всего, татарами или башкирами, принявшими русскую фамильную модель после XVI–XVII веков. Сословно они могли относиться к служилым татарам, купцам или крестьянам, но точных данных об этом нет — фамилия слишком редкая, чтобы её история была подробно описана в ономастических справочниках.