Фамилия Мухомедеев — редкий пример, когда основа, на первый взгляд, говорит сама за себя, но на деле скрывает неожиданный поворот. Самое простое и лежащее на поверхности объяснение — связь с грибом мухомором. Однако в русской ономастике прозвища, данные по ядовитым или несъедобным грибам, встречаются, но почти всегда несут ироничный или уничижительный оттенок: так могли назвать неопрятного человека, неженку («как мухомор — красивый, но в пищу не годится») или, наоборот, того, кто «вырос как мухомор» — быстро и неожиданно. Но в случае с фамилией Мухомедеев есть куда более убедительная версия, связанная с тюркскими корнями.

Словообразовательная модель фамилии — суффикс -ев, присоединённый к основе Мухомедей. Это типичная русская патронимическая форма, отвечающая на вопрос «чей?»: сын Мухомедея. Само же имя или прозвище Мухомедей, скорее всего, является искажённым или русифицированным вариантом тюркского имени. В языках тюркской группы широко распространены имена с компонентом «мухаммед» (восхваляемый, хвалимый) — Мухаммед, Мухамет, Махмут. В русской среде, особенно в регионах с татарским или башкирским населением, такие имена часто адаптировались: Мухамет → Мухамодей → Мухомодей. Сближение с «мухомором» произошло уже на русской почве из-за народной этимологии — когда непонятное слово переосмысливают через созвучное и знакомое. Таким образом, Мухомедеев — это не «сын грибника, собиравшего мухоморы», а «сын Мухаммеда», переиначенного в бытовой речи.

География фамилии это косвенно подтверждает. Мухомедеевы встречаются преимущественно в Поволжье, в Удмуртии и Татарстане, а также в Башкортостане — как раз в зоне активных русско-тюркских контактов. Вариант написания через «е» (а не через «ё») тоже характерен для фамилий, образованных от имён восточного происхождения, где ударение часто падает на последний слог: Мухомедéев.

Вторая, менее вероятная, но всё же возможная версия — прозвище от слова «мухомед» в значении «медовый мух» (тот, кто ловит мух на мёд) или «мухомор» как насмешливое прозвище знахаря (мухомор использовали в народной медицине). Но эта гипотеза слабее: прозвища от глагола «мух морить» или «мухомор» обычно давали с суффиксом -ов (Мухоморов), а не -еев. Формант -еев твёрдо указывает на имя собственное (Мухомей), а не на название предмета.

Итог: фамилия Мухомедеев — яркий пример того, как пришлое имя «Мухаммед» через цепочку фонетических изменений и народного переосмысления превратилось в русскую фамилию, звучащую почти по-сказочному. Предки носителя этой фамилии с высокой вероятностью были крещёными татарами или башкирами, принявшими православие, а сама фамилия закрепилась в форме «сын Мухаммеда» уже в русском делопроизводстве XVIII–XIX веков.