Фамилия Мухомедшин отвечает на вопрос «чей ты?» и значит «сын Мухомедши». В её основе лежит имя Мухомедша — народная, обиходная форма арабского имени Мухаммет (Мухаммад), которое переводится как «восхваляемый, прославляемый». Так что первый носитель фамилии был потомком человека, носившего это почитаемое имя, а его дети и внуки, отвечая на вопрос о родстве, называли себя Мухомедшиными — то есть принадлежащими роду Мухомедши.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий, но с восточным корнем. Суффикс -ин указывает на принадлежность: так же устроены фамилии Пушкин, Ильин, Бородин. Однако основа не славянская, а тюркская, и это сразу выдает регион, где фамилия возникла, — Поволжье и Приуралье, земли расселения татар и башкир. Именно там имя Мухаммет в разговорной речи часто приобретало формы вроде Мухаметша, Мухамедша, Мухомедша: добавление -ша — это ласкательный или уважительный вариант, характерный для тюркской антропонимии.

Интересно, что написание через «о» в первом слоге — Мухомедшин, а не Мухамедшин — отражает не столько арабский оригинал, сколько местное произношение. В татарских говорах безударный гласный в этом имени звучал редуцированно, ближе к «о», и при оформлении документов писарь фиксировал звук так, как слышал. Отсюда и разнобой в написаниях, который сохраняется до сих пор: в одних семьях пишут Мухаметшин, в других — Мухамедшин, в третьих — Мухомедшин. Все это варианты одного корня, и все они указывают на одно и то же имя-первооснову.

Сам корень Мухаммад — один из самых распространенных в мусульманском мире, поэтому однокоренные фамилии встречаются у многих народов: от татар (Мухаметшин, Мухамедшин) до народов Кавказа (Магомедов, Махмудов). Но форма с суффиксом -ша и последующим русским -ин — это уже чисто местное, волго-уральское явление. Она показывает, как имя, пришедшее из арабской традиции, прошло через тюркскую языковую среду и встроилось в русскую фамильную систему после вхождения этих земель в состав Российского государства.

Социально фамилия не была элитарной: её носили в основном крестьяне и горожане из татарских и башкирских общин, которые получали фамилии при переписях и паспортизации в XIX — начале XX века. Тогда же закрепилось и написание, которое мы видим сегодня. Конкретных исторических личностей с этой фамилией, оставивших заметный след в науке или культуре, в открытых источниках нет, но это не умаляет её ценности: за каждой такой фамилией стоит живая родословная, уходящая вглубь веков.