Фамилия Мухсинятова — редкий пример русской фамилии, образованной от полного арабского имени с добавлением русского патронимического суффикса. В основе лежит мужское имя Мухсинят (вариант: Мухсинат), которое восходит к арабскому корню «мухсин» — «делающий добро», «благодетель». Окончание «-ят» в имени — это арабский показатель множественного числа, который в тюркских языках часто переосмыслялся как часть основы. Таким образом, Мухсинят буквально значит «совершающие добрые дела» или «благодетели».

Словообразовательная модель здесь двойная. К имени Мухсинят добавили русский суффикс «-ов», а затем окончание «-а», указывающее на женский род. Фамилия Мухсинятова — это форма жены или дочери человека по фамилии Мухсинятов. Сама же мужская форма Мухсинятов возникла по типичной для XIX–XX веков схеме: русский суффикс принадлежности «-ов» присоединялся к нерусскому имени, превращая его в наследственную фамилию. Если бы фамилия образовалась раньше, в допетровскую эпоху, она могла бы звучать как Мухсинятович или Мухсинятов, но стандартизация фамилий в Российской империи закрепила именно такую форму.

Национальные корни фамилии — татарские или башкирские. Имена с корнем «мухсин» распространены у мусульман Поволжья и Приуралья. Носители фамилии Мухсинятовы, скорее всего, происходят из среды крещёных татар или из тех, кто сохранил исламскую традицию именования, но принял русскую фамильную систему. В метрических книгах и ревизских сказках Казанской, Уфимской или Оренбургской губерний можно встретить записи о людях с именем Мухсинят, чьи дети в конце XIX века уже записывались как Мухсинятовы.

В отличие от многих фамилий на «-ов», образованных от кратких форм (Иванов от Ивана), здесь исходное имя осталось полным, что делает фамилию более прозрачной для этимологии, но менее типичной для русского ономастикона. Споров о происхождении практически нет: арабский корень и тюркское посредничество очевидны. Редкость фамилии объясняется тем, что имя Мухсинят не было массовым даже в мусульманской среде — оно встречается реже, чем Мухамет или Габдулла.

Сословно предки Мухсинятовых могли быть как крестьянами, так и мещанами или купцами. В татарских и башкирских обществах фамилии такого типа не указывали на знатность: они просто фиксировали имя отца в официальных документах при переходе к наследственной фамилии. Если искать однофамильцев, то основная масса Мухсинятовых и по сей день живёт в Татарстане, Башкортостане и в соседних областях.