Фамилия Мухучева — яркий пример того, как прозвище, данное по внешности или поведению, закрепилось в родовом имени. Её основа — слово «мухуч» или «мухач», которое в русских говорах имело два основных значения. Первое — прозвище суетливого, надоедливого человека, которого сравнивали с мухой. Второе, более редкое, относилось к человеку с тёмным, «мушиным» цветом волос или глаз. В пользу первой версии говорит распространённость подобных прозвищ в крестьянской среде, где меткая характеристика легко прирастала к человеку.

Модель образования фамилии — типичная для восточнославянского ареала. Суффикс -ев- указывает на принадлежность: «Мухучев» означало «сын Мухуча». Женская форма Мухучева — это вариант, закрепившийся за женой или дочерью носителя фамилии. Интересно, что фамилия не получила распространения по всей России, а тяготеет к южным и центральным регионам, особенно к бывшим территориям Области Войска Донского и Кубани. Там, в казачьей среде, прозвища на -уч/-ач были особенно живучи.

В написании фамилии возможны варианты. В старых метрических книгах можно встретить форму «Мухучевъ» с твёрдым знаком на конце, а также редкое написание через «о» — «Мохучев», что отражает акающее произношение. Современная орфография закрепила вариант с буквой «у» в корне.

Родственных фамилий немного. С той же основой — Мухачёв, где суффикс -ач- даёт более отчётливое указание на действующее лицо. Но если Мухачёв встречается чаще, то Мухучев — более редкая, локальная ветвь, сохранившая специфический говоровый оттенок. Носительница фамилии Мухучева может с высокой вероятностью проследить свои корни в казачьих станицах или сёлах юга России, где предки получили это прозвище за характерную живость или смуглый облик.