Фамилия Мукимшоев — яркий пример того, как русская модель фамилии на -ев наложилась на иранскую (таджикскую) основу. В этом её главная особенность: перед нами не славянское прозвище, а патроним (отчество), оформленный по русскому образцу. Суффикс -ев присоединяется к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или [й], что и произошло в данном случае. Исходная форма — Мукимшое, где -шое — это притяжательный суффикс, указывающий на сына (аналог русского -ович/-евич, но на восточный манер). Таким образом, Мукимшоев буквально означает «сын Мукимшо».

В центре фамилии — личное имя Мукимшо. Оно составное, типичное для персо-таджикского именника. Первая часть, Муким, восходит к арабскому корню «акама» (стоять, пребывать) и означает «постоянный», «устойчивый», «твердый». В мусульманской культуре это имя нередко давали с пожеланием, чтобы ребенок был стойким в вере и твердым в жизни. Вторая часть, шо (от персидского шах — царь, владыка), — распространенный компонент в именах знати и простонародья, который возвышает имя, придавая ему оттенок благородства или божественной защиты. Имя Мукимшо, таким образом, можно перевести как «твердый владыка» или «постоянный шах».

Географически фамилия Мукимшоев почти наверняка родом из Таджикистана или регионов с таджикским населением (например, Узбекистан, север Афганистана). В России и других странах бывшего СССР она встречается исключительно у выходцев из этих мест. Фамилия относительно редкая и молодая: в отличие от русских фамилий XVI–XVII веков, она оформилась в советское время, когда при паспортизации аборигенных народов Средней Азии их отчества и родовые имена русифицировали через добавление -ов/-ев. До этого носитель именовался бы просто Мукимшо-зода (сын Мукимшо) или Мукимшоев без изменения — как второе имя.

Сословного значения фамилия не несёт: её мог получить и сын ремесленника, и крестьянин-дехканин. Единственная зацепка — компонент шо в имени отца. Если предок был из уважаемого рода или носил почетное звание, это могло отразиться в имени. Но чаще всего Мукимшо было просто красивым, благопожелательным именем, без привязки к реальной власти. Встречаются ли среди носителей фамилии известные люди — достоверных данных нет, но в силу редкости фамилии любой её носитель с высокой вероятностью происходит из одного узкого клана или даже одной семьи, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска.