Фамилия Муконина образована от прозвища Муконя, и корень здесь очевиден — слово «мука». Чаще всего так называли мукомола, то есть человека, который молол зерно, или торговца мукой. В старину прозвища по ремеслу были распространённым способом отличить одного человека от другого, и род занятий закреплялся за семьёй навсегда. Потомки Мукони со временем и получили фамилию Муконина.

Но есть и другая, более житейская версия. Муконей могли прозвать поварёнка, чья работа заключалась в приготовлении подлив и соусов на основе муки. Эта версия не менее правдоподобна: на кухнях, особенно в больших домах или монастырях, такая должность была отдельной и требовала сноровки, ведь подлива на муке легко комкуется и пригорает.

Существует и третья, менее убедительная гипотеза, которая выводит Муконю из тюркского имени Мукан. Его переводят двояко: «слуга, наемный работник» или «испытывающий, пробующий». Однако эта версия выглядит натянутой: слишком велик соблазн увидеть в неясном прозвище иноязычный след, тогда как русская основа «мука» лежит на поверхности и не требует привлечения внешних источников.

Сама фамилия построена по простой и типичной для русских фамилий модели: к основе Муконя добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность. То есть Муконина буквально означает «дочь или жена Мукони». Такая модель чаще встречается в северных и центральных русских говорах, где имена и прозвища на -я были особенно употребительны.

Интересно, что фамилия сохранила мягкое окончание, что говорит о её давнем закреплении в устной традиции, а не в канцелярской записи. Если бы её фиксировали по писцовым книгам, скорее всего, мы бы видели вариант Муконов. Форма на -ин указывает на то, что прозвище главы семьи было настолько естественным, что перешло в фамилию без изменений, как, например, у фамилий Сорокин или Пушкин.

Так что, независимо от того, был ли предок Мукониных мельником, торговцем или поваром, его ремесло было связано с хлебом насущным в самом прямом смысле. Фамилия не дворянская и не книжная, а народная, и в этом её ценность — она хранит память о повседневном труде, который кормил семью и дал ей имя.