Фамилия Муконин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Муконя восходит к слову «мука», т.е. Скорее всего, Муконей называли мукомола или торговца мукой. Однако прозвище Муконя мог получить и поваренок, занимавшийся приготовлением подлив на основе муки. Согласно другой, менее правдоподобной версии, Муконя – это одна из форм тюркского имени Мукан. Оно имеет два варианта перевода: «слуга, наемный работник» и «испытывающий, пробующий». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Муконя, со временем получил фамилию Муконин. О точном месте и времени возникновения фамилии Муконин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Муконин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.