Фамилия Мукштадт — редкий для России пример фамилии немецкого происхождения, сохранившей исходное написание и звучание. В отличие от большинства немецких фамилий, которые на русской почве русифицировались суффиксами -ов или -ин, Мукштадт остался «чистым» островком, что указывает на относительно позднее появление её носителей в Российской империи, скорее всего, в XVIII–XIX веках.

Основа фамилии составная. Первая часть, «Мук» (Muck, Mücke), в немецком языке имеет два значения: либо «комар, мошка», либо «каприз, дурное настроение» (в южнонемецких диалектах). Вторая часть, «штадт» (Stadt), означает «город». Таким образом, буквальный перевод — «Мошкин город» или «Капризный город». Однако в ономастике такие прозвища редко бывают прямыми. Скорее всего, Мукштадт — это топонимическая фамилия, образованная от названия населённого пункта. Известно, что в Германии существовали и существуют небольшие поселения с похожими названиями, например, Мукстедт (Muxstedt) или Мюккештадт (Mückestadt). Фамилия могла закрепиться за выходцем из такой деревни или за человеком, который владел землёй в местности, носившей неофициальное имя «Мушиное место».

Суффиксальная модель здесь отсутствует — это сложное слово (композит), типичное для немецкого способа образования фамилий от географических названий. С точки зрения социального статуса, фамилия не указывает на дворянство. Владельцы «мызы» или хутора с таким названием могли быть крестьянами, ремесленниками или мелкими арендаторами. В России носители фамилии Мукштадт традиционно встречались среди поволжских немцев и немцев-колонистов, приглашённых Екатериной II для освоения земель. После депортации 1941 года география расселения стала шире, но фамилия остаётся крайне малочисленной.

Спорных версий здесь немного: некоторые любители народной этимологии пытаются увидеть в «Мук» славянский корень «мука» (мучение), но это лингвистически несостоятельно — фамилия чётко раскладывается по законам немецкого словообразования, и вариант с «мукой» не подтверждается ни историческими документами, ни фонетикой.