Фамилия Мукушев образована от названия села Мукуш, расположенного в Черкесском районе Кабардино-Балкарии. Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Мукушевых когда-то проживал в этом селе. Возможно, название Мукуш восходит к черкесскому «мокъа» - «золотая нить».