Фамилия Мукусова — женская форма от Мукусов, и её разговор лучше начать не с корня, а с суффикса. Модель на -ов/-ев типична для русских фамилий, но основа здесь неочевидна, и это сразу выделяет фамилию из ряда привычных «ремесленных» или «патронимических». Скорее всего, в основе лежит прозвище или неканоническое имя Мукус — слово, которое не встречается в современных словарях русского литературного языка. Откуда оно могло взяться?

Первая версия — диалектная. В северных и сибирских говорах «мукус» или «мукос» могли называть человека, имеющего отношение к муке: мельника, просеивальщика, торговца, либо просто того, кто вечно белый от мучной пыли. Сравните с фамилиями Муковнин, Мукомолов, Мукоедов — все они из той же «хлебной» среды. Но в случае с Мукусовым суффикс -ус скорее указывает на иноязычный след.

Вторая версия — тюркская. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть слово «мук» или «мукус», означающее «горе», «печаль», «скорбь». Прозвище Мукус могли дать человеку с печальным нравом, молчуну, либо в охранном смысле — чтобы злые силы обходили стороной. Такие «обережные» имена были распространены у многих народов Поволжья и Урала. Фамилия Мукусов встречается у татар, башкир и русских, живущих в смешанных регионах — например, в Оренбургской, Челябинской областях, в Башкортостане. Это не единичный случай, но и не массовая фамилия: по открытым данным, сегодня в России живёт около нескольких сотен носителей, большинство — на Южном Урале.

Третья, менее вероятная версия — от греческого «мукус» (слизь), но для фамилии это слишком экзотично и не подтверждается географией. Если бы фамилия была медицинским прозвищем, она бы осталась в единичных записях или в среде врачей, а не разошлась по деревням.

Что касается сословной принадлежности: Мукусовы — почти наверняка крестьянский или мещанский род. Никаких следов дворянства или купечества первого гильдии в источниках нет. Фамилия образована не от церковного имени, а от прозвища, и это типично для поздних русских фамилий, которые закрепились за крестьянами после отмены крепостного права в XIX веке. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на первый слог: Мукусова, хотя в устной речи возможны варианты.

Коротко: если вы носите фамилию Мукусова, ваши предки, вероятно, жили на стыке русского и тюркского миров, занимались земледелием или мукомольным делом, а прозвище им дали либо по роду занятий, либо по характеру.