Фамилия Мульнючкин — редкий пример, где основа слова затемнена, а суффиксальная часть сразу бросается в глаза. Перед нами типичная «фамилия-патроним» с суффиксом -ин, который в русской модели означает «чей?» — то есть сын или потомок человека по прозвищу Мульнючка. Суффикс -к- в основе указывает на уменьшительную или уничижительную форму: так могли называть человека небольшого роста, с определённой манерой поведения или по роду занятий.

Корень «мульн-» не встречается в современных словарях литературного языка, но в северных и уральских говорах слово «муль» или «муля» означало нечто мягкое, размякшее, а также неряху или мешковатого человека. В диалектах Вологодской и Архангельской областей «мульня» — это вялый, медлительный человек, возможно, с насмешливым оттенком. Отсюда Мульня — прозвище, которое затем оформилось в Мульнючка (ласкательно-пренебрежительно) и дало фамилию Мульнючкин.

Есть и более прозаичная версия: в некоторых говорах «мулить» значило «тереть», «мять», а «мульня» — мятая одежда или тряпка. Тогда прозвище мог получить портной, который плохо гладил, или просто неаккуратный человек. Третья гипотеза связывает основу с финно-угорскими заимствованиями: в коми-пермяцком «муль» — пузырь, нарост, что могло дать прозвище человеку с бородавкой или шишкой.

Фамилия крайне редкая и географически привязана к северо-востоку европейской части России — Архангельской, Кировской областям, Пермскому краю. В дворянских родословных она не зафиксирована, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Социальный контекст простой: предок Мульнючкиных был человеком из глухой деревни, получившим уличное прозвище по внешности или характеру, которое при переписи закрепилось за всем родом.

В написании фамилии стоит обратить внимание на мягкий знак в середине: «Мульнючкин» — это не опечатка, а закономерная форма от «Мульня» через «Мульнючка». Если бы основа была «Мульна», фамилия звучала бы как «Мульнин». Такая деталь подтверждает, что прозвище имело смягчённый вариант, что типично для говоров с аканьем и цоканьем, где мягкие согласные в прозвищах встречались чаще, чем в литературном языке.