Фамилия Мунибаев — одна из тех, где корень сразу указывает на восточное, скорее всего, тюркское, происхождение. Основа «Мунибай» — это составное имя, типичное для многих народов Средней Азии и Поволжья. Первая часть, «Муни», восходит к арабскому «мунир» — «светлый», «лучезарный», «освещающий». Вторая часть, «бай», в тюркских языках означает «богатый», «господин», «хозяин». В сумме имя Мунибай можно перевести как «светлый господин» или «богатый светом». Это имя давали с пожеланием благополучия, знатности и духовной чистоты.

Суффикс «-ев» в фамилии Мунибаев — классический русский патронимический формант, указывающий на принадлежность: «сын Мунибая». Такая модель образования характерна для фамилий, которые появились у тюркских народов в составе Российской империи, особенно в XIX–XX веках, когда при переписях и оформлении документов к именам добавляли русские окончания. Таким образом, Мунибаев — это русифицированная форма, а в исходной среде фамилия могла бы звучать как Мунибай улы (сын Мунибая).

Носители фамилии Мунибаев чаще всего встречаются среди татар, башкир, казахов и узбеков. Географически она распространена в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, а также в Средней Азии. Интересно, что в русском языке ударение в фамилии может падать как на последний слог (Муниба́ев), так и на второй (Муни́баев) — это зависит от местной традиции произношения.

Сословно предки Мунибаевых, скорее всего, не принадлежали к аристократии. «Бай» в составе имени указывает скорее на зажиточного крестьянина, купца или ремесленника, но не на княжеский титул. В татарской и башкирской среде такие фамилии часто носили торговцы, скотоводы или муллы — люди уважаемые, но не из высшего дворянства. Встречается также версия, что имя Мунибай могло быть прозвищем, данным человеку с мягким, «светлым» характером, но это менее вероятно, так как составные имена с «бай» обычно давались при рождении.

Если искать аналоги, то однокоренные фамилии — Муниров, Мунирзянов, а также более редкие Мунибаевские варианты вроде Мунибай улы. Фамилия не слишком частая, но и не исчезающая: её носители живут как в России, так и в странах СНГ.