Фамилия Мункожапова — редкий пример, в котором органично сплелись бурятские корни и русская патронимическая модель. Её основа — составное мужское имя Мункожап, распространённое среди бурят и калмыков. Первая часть, «Мункэ» (монг. «мөнх»), означает «вечный», «бессмертный». Вторая часть, «жап» (от тибетского «skyabs»), переводится как «защита», «покровительство». В буддийской традиции такие имена давали, чтобы оградить ребёнка от злых сил и болезней: «вечная защита» или «вечное покровительство» — пожелание надёжного заступничества божеств на всю жизнь.

Фамилия образована по классической русской схеме: к основе имени Мункожап добавили суффикс -ов-, а затем женское окончание -а. Мужской вариант — Мункожапов. Такая модель характерна для фамилий, которые давали детям по отцу (отчество в третьем поколении закреплялось как фамилия). В бурятской среде, где испокон веков бытовали личные имена без фамилий, русификация произошла в XIX — начале XX века, во время активного взаимодействия с русской администрацией и православными миссиями. Поэтому большинство носителей фамилии — потомки бурятских родов из Забайкалья или Иркутской области.

Стоит отметить, что в тибетско-монгольских именах часто встречается «жап» как самостоятельная часть: Гомбожап, Цыренжап, Доржижап. Фамилия Мункожапова — одна из тех, где славянский суффикс прирастили к целому составному имени, а не к его части. Это говорит о том, что предок носителя при переходе на русскую систему записал полное имя отца без сокращений. Если бы процесс шёл иначе, могли бы появиться варианты вроде Мункэев или Жапов — от отдельных компонентов.

Встречаемость фамилии невысокая: она сосредоточена в Бурятии, Забайкальском крае и среди бурятской диаспоры в крупных городах. В дореволюционных метрических книгах её почти нет — буряты массово получали фамилии уже при советской власти, когда паспортизация затронула кочевые и полукочевые народы. Поэтому точную дату появления фамилии назвать сложно, но её форма однозначно указывает на конец XIX — начало XX века.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком: суффикс -ов- здесь не указывает на русское происхождение основы, а лишь оформляет её по-русски. Это типичный случай, когда нерусское имя обрело письменную фамилию, не изменив внутреннего смысла. Носительница такой фамилии может быть уверена: её предки — буряты-буддисты, а имя родоначальника содержало сильное пожелание вечной небесной защиты.