Фамилия Муркин — одна из тех, что образованы не от крестильного имени, а от прозвища. Основой послужило слово «Мурка», а оно, в свою очередь, ведет начало от глагола «мурчать» — то есть «урчать, ворчать», как это делает зверь. Вопреки возможному интуитивному смыслу, вряд ли это прозвище закреплялось за ворчливым или вспыльчивым взрослым человеком. Скорее всего, так родители ласково называли ребенка, который, например, что-то напевал себе под нос или издавал забавные звуки. Поэтому потомок человека с таким домашним прозвищем и получил фамилию Муркин.

Модель образования здесь классическая для русских фамилий: к основе на -а добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность «сын Мурки». Это же правило работает в фамилиях Пушкин (от Пушка), Галкин (от Галка) и множестве других. Суффикс -ин в данном случае не несет пренебрежительного оттенка, а лишь фиксирует родство.

Поскольку прозвище Мурка звучит скорее как домашнее, внутрисемейное, фамилия Муркин могла возникнуть в среде, где у людей еще не было закрепленных наследственных именований — то есть среди крестьян и посадских людей. Это не дворянская фамилия, а народная, что делает ее особенно живой: она сохранила память о том, как в конкретной семье называли своего ребенка несколько веков назад.

Интересно, что у фамилии есть «родственники» — Муркин, Мурков, Мурковский. Но если Муркин и Мурков прямо выводятся из прозвища Мурка, то Мурковский, скорее всего, имеет топонимическое происхождение и связан с названием деревни или села. Так что Муркин стоит особняком: его история не про географию, а про личное, почти интимное прозвище.