Фамилия Мусагаджиев — яркий пример того, как в одной русской фамилии сохранилась целая исламская традиция именования. Она образована от составного мужского имени Муса-Гаджи (или Мусагаджи), где первая часть — Муса — арабская форма имени библейского пророка Моисея (в Коране — Муса), а вторая — Гаджи — почётный титул, который получал мусульманин, совершивший хадж в Мекку. Таким образом, имя Мусагаджи буквально означало «Муса-паломник» или «Муса, совершивший хадж». В русской среде это имя превратилось в фамилию с помощью типичного для России суффикса принадлежности -ев, который добавляется к основам на мягкий согласный или -й: Мусагаджи → Мусагаджиев. Фамилия указывает на то, что предок носителя был человеком верующим и уважаемым в своей общине: имя Гаджи давалось не при рождении, а как почётное прозвище после паломничества.

Фамилия Мусагаджиев имеет отчётливую региональную привязку. Она распространена в основном среди народов Дагестана (особенно аварцев, даргинцев, кумыков и лезгин), а также среди чеченцев и ингушей. В этих культурах составные имена с компонентом «Гаджи» — явление массовое: Гаджимурад, Гаджиахмед, Абдулгаджи и т.д. Однако в фамилии Мусагаджиев интересен порядок частей: обычно титул «Гаджи» стоит на первом месте (Гаджимуса), а здесь он — на втором, что реже, но встречается. Это может говорить о том, что имя было образовано не по строгому канону, а как народное, «бытовое» прозвище, которое позже закрепилось в документах.

Словообразовательная модель проста, но показательна. В отличие от фамилий на -ов/-ев, образованных от чисто русских имён, здесь суффикс прикреплён к нерусской основе, которая не склонялась по русским падежам. Это типично для фамилий народов Кавказа, вошедших в состав Российской империи в XIX веке: их фиксировали писарями, которые русифицировали окончания. Поэтому Мусагаджиев — не «исконно русская» фамилия, а русифицированная форма горского имени, что подтверждает её происхождение из среды, где исламские имена и титулы были в ходу задолго до появления фамилий как таковых.

Если сравнивать с однокоренными, то Мусагаджиев стоит в одном ряду с фамилиями Мусаев, Гаджиев, Гаджимусаев. Разница в том, что Мусаев — от простого имени Муса, Гаджиев — от титула Гаджи, а Мусагаджиев — от сложного имени, которое уже само по себе было «микроисторией»: оно рассказывало, что человека зовут Мусой, и он побывал в Мекке. Такая фамилия — редкий случай, когда в одном слове зашифрованы и личное имя, и социальный статус предка.