Фамилия Мусаитова ведет начало от личного имени Мусаит. Чаще всего его считают фонетическим вариантом арабского имени Мусаид, которое переводится как «помощник», «поддержка». Родители, называя сына Мусаитом, вкладывали в это имя пожелание, чтобы он вырос сильным, ответственным и стал опорой для родных. Такой человек, в свою очередь, передал своё имя детям, а те, уже по русской традиции, получили отчество, закрепившееся как фамилия: потомок Мусаита — Мусаитов, а его жена или дочь — Мусаитова.

Фамилия строится по самой распространенной модели русского именования: к основе, оканчивающейся на согласный, добавляется суффикс -ов. Это типичный «патронимический» суффикс, указывающий на принадлежность к отцу или предку. В данном случае он оформил имя собственное в фамилию, не меняя его звучания.

Стоит обратить внимание и на сам корень. Имя Мусаид, а вместе с ним и форма Мусаит, широко бытует у народов, исповедующих ислам, — у татар, башкир, чеченцев, народов Дагестана и Средней Азии. Поэтому фамилию Мусаитову чаще всего можно встретить в тех регионах России, где исторически сильны эти культуры, — в Поволжье, на Урале, на Северном Кавказе. Впрочем, точную географию и время появления конкретного рода без генеалогического исследования не установить: процесс закрепления фамилий растянулся на несколько столетий, и в разных семьях он проходил в разное время.

Интересно, что форма Мусаит — не единственный вариант этого имени. Встречаются также написания Мусаид, Мусаитдин, а от них — однокоренные фамилии Мусаитов, Мусаидов, Мусаитов. Все они восходят к одному смысловому ядру — «помощь, поддержка», и все они говорят о том, что предок носителя такой фамилии был человеком, на которого можно было положиться.