Фамилия Мусанапов — яркий пример того, как тюркское имя и русский суффикс создали фамилию, которая звучит непривычно для уха, но строго следует законам русской ономастики. Её основа — мужское имя Мусанап. Это сложносоставное имя, характерное для мусульманских народов Поволжья и Средней Азии. Первая часть — Муса (библейский Моисей в исламской традиции, один из почитаемых пророков). Вторая часть — Нап, что в переводе с арабского означает «вид, подобие, образ». Таким образом, имя Мусанап можно истолковать как «подобный Мусе» или «похожий на пророка Мусу» — имя с пожеланием ребёнку быть благочестивым и достойным.

Модель образования фамилии — притяжательное прилагательное с патронимическим суффиксом -ов. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образовывались от имён отцов: Мусанап — сын Мусанапа — Мусанапов. Суффикс указывает на то, что фамилия сложилась в русскоязычной среде или в среде, где документы оформлялись на русском языке. Это отличает её от исконно тюркских фамилий, которые часто оканчиваются на -ов/-ев, но могли сохранять и другие форманты.

Географически фамилия Мусанапов тяготеет к регионам, где исторически жили татары и башкиры. Встречается она и у казахов, но реже. Основной ареал — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. В этих местах имя Мусанап (иногда в форме Мусанаф) фиксируется в метрических книгах и ревизских сказках XIX века, но никогда не было массовым — это относительно редкое имя, что делает фамилию нечастотной.

С точки зрения социального статуса предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами. В дворянских родословных книгах Мусанаповы не значатся. Фамилия не несёт указания на конкретное ремесло или сословие — она чисто патронимическая, то есть образована от личного имени. Интересно, что в некоторых говорах имя Мусанап могли произносить с ударением на последний слог, что привело бы к варианту Мусана́пов, но литературная норма фиксирует ударение на третьем слоге: Мусана́пов.