Фамилия Мусаохунов — редкий пример фамилии, образованной от арабского имени с тюркским суффиксом, но записанной по русской патронимической модели. Её основа — мужское имя Мусаохун, которое состоит из двух частей: имени пророка Мусы (библейский Моисей) и компонента «охун» (вариант «хон» или «хан»). В тюркских языках Средней Азии «хон» (хан) добавляли к именам как уважительный титул или ласкательную частицу, примерно как «господин» или «дорогой». Таким образом, Мусаохун — это «господин Муса» или «уважаемый Муса».

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Мусаохун прибавили суффикс -ов, который в данном случае указывает на принадлежность («чей?» — Мусаохун-ов, то есть потомок Мусы). Окончание -ов типично для фамилий, которые оформлялись в канцеляриях Российской империи при записи нерусского населения. Интересно, что в самой тюркской среде такая фамилия могла бы звучать как Мусаохун-заде (с персидским суффиксом «рождённый») или просто остаться именем без фамильного оформления. Выбор именно русского суффикса говорит о том, что предки носителя жили на территории, где велась документация на русском языке — скорее всего, в Туркестане, в Ферганской долине или среди узбеков и таджиков, которые в XIX–XX веках получали фамилии по отчеству.

Географически фамилия тяготеет к Узбекистану, Таджикистану и приграничным районам Кыргызстана. Встречаемость крайне низкая: например, в открытых базах данных России зафиксированы единичные случаи, в основном у мигрантов или потомков выходцев из Средней Азии. Важная деталь: написание «Мусаохунов» (через «а») — это результат адаптации арабской буквы «вав» (звук, средний между «у» и «о») в русской записи. В оригинале имя могло произноситься как «Мусо-хон», но при документировании закрепился вариант «Мусаохун», что нередко для фамилий, записанных со слуха чиновниками.

С точки зрения социального происхождения, фамилия не указывает на конкретное сословие. В дореволюционной Средней Азии фамилии по имени отца получали все, независимо от статуса — от ремесленника до торговца. Однако компонент «хан» в имени мог говорить о том, что предок пользовался авторитетом, хотя это скорее вежливое обращение, чем реальный титул. Прямых известных носителей фамилии в истории нет — это фамилия обычных людей, чья родословная уходит в оседлые земледельческие или ремесленные общины Мавераннахра.