Фамилия Муссаева образована от имени Мусса, которое представляет собой вариант имени Муса. Оно образовано от древнееврейского существительного «мешу» со значением «ребенок» и является арабским вариантом имени Моисей. Пророк Муса является одним из благословенных посланников Аллаха, о миссии которого рассказывают многие аяты Корана. Он и его брат Пророк Харун вели борьбу против жестокого правления фараона и спасли народ Израилев от угнетения египтян. Как сообщается в Коране, Аллах призвал Мусу на гору Тур, чтобы передать ему заповеди для его народа. Таким образом, потомок человека, которого звали Мусса, со временем получил фамилию Муссаев. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому точно определить время и место происхождения рода Муссаевых можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.