Фамилия Мужиканова — женская форма, образованная от мужской фамилии Мужиканов. В центре внимания оказывается суффикс -анов. В русской ономастике это редкий, почти уникальный вариант. Обычно фамилии строятся по модели -ов/-ев (Мужиков) или -ин (Мужикин). Суффикс -анов чаще встречается в тюркских фамилиях (например, Ахметжанов), но в русской среде он может указывать на два пути: либо на происхождение от прозвища через притяжательное прилагательное «Мужиканов» (чей? — сын Мужикана), либо на адаптацию тюркского имени или прозвища, где -ан — уменьшительный или усилительный аффикс.

Основа фамилии — «мужик». В древнерусском языке слово «мужик» означало не просто крестьянина, а взрослого мужчину, мужа, свободного человека. В XV–XVII веках «мужиками» называли простых горожан и сельских жителей, противопоставляя их боярам и служилым людям. Прозвище Мужик могли дать человеку крепкого телосложения, самостоятельному, либо, наоборот, в насмешку — тому, кто вёл себя грубо или не по чину. Форма Мужикан — это уже ласкательное или уменьшительное производное от «мужик», что-то вроде «мужичок». Встречается в северных и сибирских говорах, где -ан добавляли к именам и прозвищам (Иван — Ивашкан, мужик — мужикан).

Регионально фамилия Мужиканов (и её женский вариант) тяготеет к югу России и Поволжью, где активнее шло смешение с тюркскими языками. В башкирской и татарской среде слово «мужык» могло заимствоваться с тем же значением, а суффикс -анов — типичный для фамилий из этих культур. Поэтому возможно, что предок носителя фамилии был не русским крестьянином, а татарином или башкиром, получившим прозвище «Мужик» за характер или внешность.

В отличие от более частых «Мужиков» или «Мужичкин», фамилия Мужиканова сохраняет редкую словообразовательную конструкцию. Если искать аналоги, то ближе всего стоят фамилии вроде «Казаканов» (от «казак») или «Солдатанов» (от «солдат»), где социальная роль переходит в фамилию через тюркизированный суффикс. В любом случае, носительница фамилии может быть уверена: её предки не были безликими — прозвище «мужикан» выделяло их среди окружающих, будь то в русской деревне или на окраинах империи.