Фамилия Мяготин происходит от прозвища Мягота, которое носил далекий предок. Чаще всего такое прозвище связывали с характером: в основе лежит прилагательное «мягкий» в значении «кроткий, уступчивый», «душевный, отзывчивый», «лишенный резкости и грубости». Мяготой могли назвать человека покладистого, избегающего ссор, либо, напротив, полного и тучного — здесь срабатывала та же логика, что и в прозвищах Мякиш или Мягкий.

Но есть и другая версия, не менее убедительная. Она возводит прозвище к слову «мякоть», которое в разных говорах имело конкретные бытовые значения. В пермских говорах мякотью называли мелкие отруби, в тульских — связку льна, а в ярославских — паханую землю, поле, с которого снят один хлеб. Если придерживаться этой гипотезы, Мягота — «профессиональное» именование, указывающее на род занятий: мельник, работавший с отрубями, крестьянин, обрабатывавший поле, или человек, имевший дело со льном.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Мяготин буквально значит «сын Мяготы», «тот, кто из семьи Мяготы». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и личных имен, и закрепилась в северных и центральных регионах России.

Родственные именования встречаются в исторических документах. В труде С. Б. Веселовского упоминаются Иван Мякота Прасолов (1500 год, Новгород) и Григорий Мякотин, посадский человек (1625 год, Зарайск). Эти записи показывают, что прозвище бытовало в разных слоях общества — и среди торговых людей, и среди посадских. Кстати, форма Мякота/Мягота могла писаться по-разному, что отражает живую народную традицию произношения.

Точное время и место возникновения фамилии Мяготин установить сложно: процесс формирования фамилий был долгим и не всегда привязан к одной местности. Ясно одно — фамилия сохранила память о прозвище, которое либо описывало характер человека, либо указывало на его работу. Окончательные выводы о происхождении конкретной ветви Мяготиных возможны только после глубоких генеалогических изысканий.