Фамилия Мыкито — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её происхождение напрямую связано с разговорными формами крестильных имён, а точнее — с именем Никита. В народной среде имя Никита произносили с «яканьем» или «ыканьем» — отсюда пошли формы Микита, Мыкита. Фамилия Мыкито образована по западнорусской или украинской модели: суффикс -о характерен для фамилий, возникших в Беларуси, на западе Украины и в южнорусских областях. В таких фамилиях окончание -о указывает на прозвищное или именное происхождение: Мыкито — это буквально «сын Мыкиты» или просто человек по прозвищу Мыкито, то есть Никита.

Если приглядеться к суффиксу, то он необычен для центральной России, где преобладают фамилии на -ов/-ев и -ин. Форма Мыкито скорее говорит о том, что предок носителя фамилии жил в зоне влияния белорусского или украинского языка. В этих землях фамилии на -о (Шевченко, Коваленко) — обычное дело, но для имени Никита такое окончание встречается реже. Возможно, фамилия закрепилась в какой-то отдельной местности, где имя Мыкита было особенно употребительным.

Другая версия, менее вероятная, связывает фамилию с прозвищем от диалектного слова «мыкать» — скитаться, ходить без дела, или же от «мыкать» в значении «дергать, теребить». Но тогда логичнее было бы ожидать фамилию Мыкало или Мыкаль, а не Мыкито. Скорее всего, перед нами именно фонетический вариант имени Никита, адаптированный местным говором.

По сословной принадлежности носители фамилии Мыкито, скорее всего, были крестьянами или мещанами — фамилия не имеет признаков дворянского оформления (суффиксы -ский, -ич) и не встречается в родословных книгах. География бытования фамилии сегодня указывает на западные регионы России, а также на Украину и Беларусь, что подтверждает её западнорусские корни.