Фамилия Мырзенку — редкий случай, когда в русском ономастиконе встречается фамилия, образованная не по русской модели, а по молдавской (румынской). Её основа — распространённое восточное имя или титул «Мырза» (вариант «Мурза», от персидского «мирза» — «сын эмира», «князь», «писарь»). В тюркских и кавказских языках мурза — это представитель знати, часто грамотный человек при дворе. Однако суффикс «-енку» — совершенно иного происхождения.

Суффикс -енку (или -енко) — типичный для украинских и молдавских фамилий. В Молдавии и на юго-западе Украины он выполнял ту же роль, что и русское -ов/-ев: указывал на принадлежность к роду. Мырзенку буквально означает «сын Мырзы» или «потомок человека по прозвищу Мырза». Сочетание тюркского корня с восточно-романским суффиксом — характерная черта пограничья, где смешивались языки и культуры, особенно на землях бывшего Молдавского княжества и Бессарабии.

Географически фамилия привязана к зоне между Днестром и Прутом, а также к Причерноморью. В дореволюционных метрических книгах Херсонской, Подольской и Бессарабской губерний можно встретить носителей фамилии Мырзенку — это были крестьяне или мещане, чей предок получил прозвище за степенность, знатное происхождение (возможно, из обедневших татарских мурз) или за работу писарем. Важно: в русском языке фамилия часто искажалась — в документах XIX века встречаются написания «Мырзенко», «Мурзенко» и даже «Мерзенко», что связано с аканьем и неразличением звуков.

В отличие от фамилий на -ов, которые указывали на вотчину или службу, суффикс -енку в этом случае подчёркивает именно личное прозвище основателя рода. Прямых аналогов в русской среде у Мырзенку немного: ближе всего фамилии вроде Мурзаев или Мурзалиев, но они образованы по другой модели. Мырзенку — пример того, как восточный титул «прижился» в молдавской деревне и превратился в фамилию, не имеющую отношения ни к княжескому титулу, ни к русскому дворянству.