Фамилия Мысенков, вероятно, образована от имени Мыся, которое является производной формой имени Моисей. Оно в переводе с древнееврейского означает «дитя» или «вынутый из воды». Святым покровителем этого имени считается пророк Моисей. Призванный богом спасти израильские племена из фараоновского рабства, Моисей вывел их из Египта сквозь расступившиеся воды «Чермного» (Красного) моря. Возможно также, что имя Мыся берет начало от псковского нарицательного «мысь», то есть «белка». Давая младенцу имя со значением «белка», родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное. Таким образом, именование Мысенко получил «маленький Мыся», то есть сын Мыси. Фактически фамилия Мысенков представляет собой отчество второго порядка: Мысенков - сын Мысенко и внук Мыси.