Фамилия Набежко звучит на украинский лад, и это первая зацепка для её разбора. Суффикс -ко — один из самых характерных для украинских фамилий, образованных от прозвищ или имён. Он указывает на уменьшительность или принадлежность: буквально «маленький Набег» или «сын Набега». Основа здесь — «набег», то есть внезапное нападение, стремительный налёт.

Скорее всего, предок носителя фамилии получил прозвище Набег. В среде казаков, пограничных жителей или даже разбойников такое прозвище могли дать человеку дерзкому, быстрому, который действовал внезапно и уходил без следа. Не исключено, что прозвище закрепилось за участником военных походов — «набежчик», то есть тот, кто ходит в набеги. Вариант с ударением на второй слог (Набежко) типичен для центральной и восточной Украины, а также для южнорусских областей, где украинская модель фамилий прижилась.

Есть и более прозаическая версия: фамилия могла возникнуть из топонима. В Полтавской и Черниговской губерниях встречались хутора с названиями вроде Набеж, Набежное. Переселенцы, покинувшие эти места, получали фамилию по названию родного села — Набежко. В таком случае основа теряет воинственный оттенок и становится просто географической меткой.

В официальных документах XIX века фамилия встречается в основном среди крестьян и казаков. Дворянского корня у Набежко нет — это фамилия людей, чья история связана с землёй, войной и переселениями. Редкий суффикс -жк- (а не более привычное -енко или -ук) делает её узнаваемой и указывает на конкретный регион: скорее всего, современные Сумская, Полтавская или Черкасская области Украины.