Фамилия Наболотная — яркий пример того, как географический признак стал родовым именем. Её основа — слово «болото», а приставка «на-» указывает на расположение у этого объекта. В говорах «наболотный» означало «живущий у болота, на болотистой почве». Таким образом, первый носитель фамилии получил прозвище Наболотный (или Наболотная для женщины), которое затем закрепилось за потомками.

Словообразовательная модель здесь необычна. В отличие от распространённых фамилий на -ский (Заболоцкий, Подболотин), которые часто давались по названию села или усадьбы, форма Наболотная сложилась из прилагательного с предлогом, перешедшего в прозвище. Суффикс -н- в основе указывает на признак места, а окончание -ая — на женский род (в мужском варианте фамилия звучала бы как Наболотный). Такое окончание типично для южнорусских и украинских фамилий, где женская форма часто становилась общесемейной, если глава рода был записан как Наболотная.

Вероятнее всего, фамилия возникла в среде крестьян или однодворцев, живших на окраинах болотистых низин — в Полесье, на Смоленщине или в Черниговской губернии. Болота там были не только помехой, но и источником ресурсов: клюквы, торфа, дичи. Прозвище Наболотный могло закрепиться за человеком, чей дом стоял на сырой земле, или за тем, кто промышлял на болотах.

Встречаются и более редкие варианты написания — через два «о» (Наоболотная) или с ударением на второй слог (Наболо́тная). Это связано с местными говорами, где предлог «на» мог сливаться с корнем не полностью. В документах XIX века фамилия фиксируется как в мужском, так и в женском роде, но в современной России чаще встречается именно форма Наболотная, что может указывать на передачу фамилии по материнской линии в какой-то из ветвей рода.

Однокоренные фамилии (Заболоцкий, Болотников, Болотов) образованы от того же корня, но с разными приставками и суффиксами. Наболотная отличается от них именно приставкой «на-», которая конкретизирует положение: не просто «относящийся к болоту», а «находящийся на болоте». Эта деталь позволяет предположить, что предки носителей фамилии жили не рядом с болотом, а прямо на его краю или на осушенном участке.