Фамилия Надыко звучит необычно, но её происхождение укладывается в несколько типичных для юга России и Украины моделей. Ключ к разгадке — суффикс -ко. Это характерный уменьшительный или фамильный формант, который в XVI–XVIII веках активно использовался в украинской, белорусской и польской антропонимии. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, фамилии на -ко чаще всего образовывались напрямую от прозвища или имени без патронимического суффикса в середине.

Основа Нады- может восходить к нескольким источникам. Самая прямая версия — от украинского глагола «нади́ти» (ладить, налаживать, а также угождать или задабривать). В этом случае прозвище Надыко могли дать человеку уживчивому, покладистому, который умел «надить» с людьми. Вторая версия связывает основу с диалектным словом «нада» (нужда, необходимость) или даже с южнорусским «надысь» (недавно, намедни), но такое прозвище звучало бы странно — скорее всего, это следы иного корня.

Третий, менее очевидный, но возможный вариант — происхождение от личного имени Надым (как вариант имени Надим арабского происхождения, означающего «собеседник», «друг»). Через тюркское посредничество такие имена попадали в казачью среду. Фамилия Надыко могла закрепиться за потомками казака или крестьянина, носившего такое имя.

Географически фамилия тяготеет к юго-западу бывшей Российской империи: её носители встречаются в Черниговской, Полтавской, Харьковской губерниях, а также на Кубани, куда переселялись запорожские и малороссийские казаки. В польских источниках встречается схожая фамилия Nadуko, что подтверждает её западнорусскую природу.

Социальный контекст прост: фамилия недворянская. В реестрах казацкой старшины или шляхты Надыко не значится. Скорее всего, предки были казаками, мещанами или государственными крестьянами. В XIX веке носители фамилии числились в основном среди однодворцев и бывших казаков, что подтверждает её «простую» ремесленную или служилую основу.