Фамилия Наджафлы — характерный пример азербайджанской и в целом тюркской модели образования фамилий с помощью суффикса -лы/-ли. В русской передаче этот суффикс часто закрепляется в форме -лы, хотя по правилам азербайджанской орфографии он пишется как -lı (после твёрдых гласных) и -li (после мягких). Суффикс этот означает принадлежность к чему-либо или обладание чем-то. В контексте фамилий он чаще всего указывает на происхождение из определённого места или на отношение к роду.

Основа фамилии — личное имя Наджаф. Это арабское имя (Наджаф, Najaf) восходит к корню со значением «высокое место», «возвышенность», а в переносном смысле — «почитаемый», «благородный». В исламской традиции имя особенно известно благодаря городу Эн-Наджаф в Ираке — одному из священных городов шиитов, месту захоронения имама Али. Таким образом, имя могло даваться в честь этого города или просто как благопожелательное, с намёком на возвышенный статус.

Фамилия Наджафлы, следовательно, означает «из рода Наджафа», «относящийся к Наджафу» или, если исходить из топонимического прочтения суффикса, «выходец из Наджафа» (то есть из города или местности с таким названием). Однако для азербайджанских фамилий более типично патронимическое значение: «сын/потомок Наджафа». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые тоже указывают на отца, тюркский суффикс -лы подчёркивает не столько прямое отчество, сколько родовую принадлежность, клановость.

С точки зрения социального контекста, фамилии на -лы в Азербайджане и соседних тюркских регионах (туркмены, турки) были распространены среди разных слоёв населения, но особенно часто встречались у сельских жителей, где принадлежность к определённому роду или общине имела первостепенное значение. В советский период многие носители фамилий на -лы русифицировали их, добавляя окончания -ов или -ев (получая вариант Наджафов). Поэтому фамилия Наджафлы в её исконной форме — признак того, что семья либо сохранила традиционное написание, либо восходит к азербайджанским корням, не затронутым массовой русификацией. Встречается она преимущественно в Азербайджане, а также в азербайджанских диаспорах в России, Турции и Иране.