Фамилия Нагимулина происходит от арабского мужского имени Нагимула, которое представляет собой вариант более известного имени Нагимулла. Если разобрать это имя по составу, то мы увидим два смысловых блока: «нагим» — счастье, спокойствие, благополучие и безбедная жизнь, а также сладкий вкус, удовольствие и наслаждение, и «улла» — от арабского Allah, то есть «бог». Полный перевод имени на русский язык звучит как «обилие, богатство, счастье Аллаха».

Нарекая сына именем Нагимула, родители вкладывали в него пожелание, чтобы ребенок вырос достойным мусульманином и жил под покровительством Всевышнего. Имя это составное, и в этом его особенность: подобные двухосновные имена с компонентом «улла» (Аллах) характерны для мусульманской традиции и часто становились основой фамилий у татар, башкир и других народов, исповедующих ислам.

Сама фамилия образована по типичной для русского языка модели: к основе имени добавили суффикс -ин и окончание -а, что указывает на принадлежность к роду. Форма Нагимулина — это женский вариант, а мужской, соответственно, Нагимулин. Такой словообразовательный путь говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где русская грамматика соединилась с тюрко-мусульманской антропонимией.

Процесс формирования фамилий у разных народов был длительным и неоднородным. У крещёных татар и в русскоязычной среде фамилии на -ин и -ов появлялись в разное время, часто в XVII–XIX веках, когда возникла необходимость фиксировать род в официальных документах. Поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Нагимулиных можно только на основании генеалогических исследований — архивных записей, метрических книг и ревизских сказок.

Стоит учесть и редкую особенность написания: в основе имени встречается вариант «Нагимула» без удвоенной «л», что отражает особенности произношения в некоторых диалектах. Именно эта форма и закрепилась в фамилии, отличая её от более распространённых однокоренных вариантов вроде Нагимуллин. Впрочем, обе фамилии восходят к одному имени и несут в себе одно пожелание — благополучия и божественной милости.