Фамилия Накисько хранит в основе прозвище Накись, и это редкий случай, когда за ней стоит не имя или ремесло, а бытовое слово с неожиданной образностью. В говорах накисью называли то, что, прокиснув, оседает на дно и стенки посуды — тот самый осадок, который появляется в скисшем молоке или квасе. Согласитесь, прозвище колкое и меткое: так могли в шутку окликнуть вялого, болезненного человека, который «скис» и не подаёт признаков жизни, либо капризного плаксивого ребёнка, чьё настроение портится так же быстро, как молоко в тепле.

Суффикс -ко в фамилии Накисько указывает на украинскую или южнорусскую почву: такие формы с уменьшительным или «сыновьим» оттенком массово встречаются на Левобережной Украине, в Подолье и в прилегающих русских областях. По модели это типичное «прозвище отца + семейный суффикс»: Накисько буквально значило «сын Накися» или «человек из рода Накися». Со временем прозвище, которое сначала прилепилось к человеку в быту, вытеснило наследственное имя и закрепилось в документах уже как полноценная фамилия.

Важно не путать эту основу с похожими по звучанию словами. Накись — не «накипь» и не «накидка», хотя в народной этимологии их иногда сближают. Накипь — это то, что всплывает и пригорает, а накись, наоборот, опускается вниз. Разница принципиальная, и она подсказывает, что прозвище родилось именно в среде, где молочные продукты и квас были повседневной пищей, а наблюдательность к их свойствам — обычным делом.

Сам прозвищный пласт, к которому относится Накись, в ономастике изучен неплохо: Б. Унбегаун и В. Никонов отмечали, что русские и украинские фамилии нередко вырастали из таких «кухонных» и бытовых слов, которые сейчас забыты. Параллели — фамилии Кваша, Опара, Сыворотка: все они тоже начинались с прозвищ, данных по сходству человека с чем-то кислым, тягучим или неаппетитным. Так что Накисько стоит в одном ряду с этими ёмкими, немного насмешливыми прозвищами, которые со временем утратили свою колкость и стали просто фамилиями.

Встречаемость фамилии невысокая, она не принадлежит к числу массовых, и это дополнительный аргумент за то, что она закрепилась в одном конкретном роду, а не разошлась по множеству семей. Носители Накисько сегодня живут в основном на Украине и в южных областях России, что согласуется с ареалом суффикса -ко. Если ваши предки носили эту фамилию, можно с высокой долей уверенности предполагать, что родом они из казацкой или крестьянской среды, где прозвища давали метко и без сантиментов.