Фамилия Наликина образована по самой распространённой в русской ономастике модели — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Налики. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Налика. И вот тут начинается самое интересное: корень «нал-» в русских говорах многозначен, и точное значение зависит от региона.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с глаголом «налить» и существительным «наливка». В северных и центральных губерниях «наликой» могли прозвать любителя хмельных напитков, бражника. Менее очевидный, но лингвистически оправданный вариант — от диалектного слова «налика» в значении «налим» или вообще «рыба, которую наливают (то есть ловят в половодье)». В таком случае прозвище мог получить рыбак или человек, торговавший рыбой.

Обратим внимание на суффикс -ик- в основе. Это уменьшительный или пренебрежительный формант, который в прозвищах часто смягчал характеристику. Налика — не просто «тот, кто наливает», а скорее «маленький наливала» или «Налий, но с ласковым оттенком». Такие формы были типичны для бытовых имён в XV–XVII веках, когда отчество ещё не застыло в фамилию.

Географически фамилия Наликина встречается в основном в центральных областях России, особенно в бывших Владимирской и Нижегородской губерниях. Там же фиксируются и однокоренные фамилии — Налимов, Наливкин, Налимовский. Сравнение с ними показывает, что Наликина — более редкий вариант, возможно, возникший в конкретной местной среде, где прозвище Налика было употребительнее, чем более грубое Налим.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или посадским людям. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» нет. Это не делает её менее интересной: именно такие «простые» фамилии часто сохраняют живые черты народной речи, утраченные в книжных вариантах.