Фамилия Наток — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет ни одного из типичных фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский), что сразу наводит на мысль: перед нами либо застывшее прозвище в чистом виде, либо фамилия, образованная от географического названия или иноязычного корня.

Скорее всего, основа фамилии — древнерусское или диалектное слово «наток». В говорах севера и северо-запада Руси «наток» означало «натек», «наплыв», «нечто набежавшее» — например, вода, набежавшая на лёд, или слой чего-то, наросший сверху. В переносном смысле так могли прозвать человека с густыми, «натекшими» бровями или с какой-то особенностью кожи — родимым пятном, наростом. Прозвище могло быть ироничным: наток — тот, кто «натек», то есть пришлый, чужак, случайно оказавшийся в селении.

Другая версия — связь с глаголом «наткать». В этом случае Наток — сокращение от прозвища Наток (то есть «наткал», много наткал), которое давали ткачу или человеку, занимавшемуся домашним ткачеством. Такие прозвища, образованные от глаголов в прошедшем времени, встречаются в русской антропонимии: например, Звал, Ковал, Пек.

Третья, менее вероятная, но возможная версия — фамилия тюркского происхождения. В татарском и башкирском языках есть слово «нат» (название, слава) с аффиксом -ок. Тогда Наток могло означать «известный», «знаменитый» или быть уменьшительной формой имени Нат.

Фамилия Наток встречается в основном в южных и центральных регионах России, а также среди казачества. Из-за своей редкости и отсутствия типичного суффикса она не попала в массовые переписи и не обросла сословной историей. Носителей фамилии — единицы, и большинство из них живут в Краснодарском крае и Ростовской области.

Суффикс -ок в русских фамилиях обычно указывает на уменьшительность или принадлежность к чему-то малому, но здесь он, скорее, часть корня: фамилия застыла в форме прозвища, не став «Натоков» или «Натокин». Это редкий случай, когда фамилия сохранила исходное звучание без наращивания патронимических окончаний.