Фамилия Наухацкая звучит необычно для русского уха, и её происхождение напрямую связано с украинской или белорусской языковой средой. В основе лежит суффикс -цк-, характерный для фамилий шляхетского или географического происхождения: он указывает на связь с местностью. Мужской вариант — Наухацкий, женский — Наухацкая.

Самый вероятный корень — топоним. На Украине и в Беларуси есть несколько сел с похожими названиями: Науховка, Науховичи, Наухатки. Фамилию могли получить выходцы из такого поселения. Например, человек, переехавший из села Наухатка в другой регион, становился «Наухацким», то есть «тем, кто из Наухаток». Суффикс -ск-/-цк- в восточнославянских фамилиях часто выполнял именно эту функцию — привязывал прозвище к месту жительства предка.

Менее распространенная версия выводит основу от прозвища Наух. В украинских говорах слово «науха» могло означать человека с большими ушами или того, кто любит подслушивать (от «вухо» — ухо). Однако в таком случае фамилия скорее получила бы суффикс -енко (Наухенко) или -ук (Наухук), характерный для прозвищ. Форма на -цкий указывает на шляхетский или крестьянский «географический» тип фамилий, распространенный на Правобережной Украине и в Беларуси.

С точки зрения ударения, фамилия произносится с ударением на второй слог: Нау́хацкая. В написании важно не путать с редкой фамилией Нахацкая (от корня «нахал» или «нахил»). Фамилия Наухацкая — довольно редкая, в основном встречается в западных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. Сословно носители могли быть как мещанами, так и казаками, но чаще — крестьянами, получившими фамилию по названию своего хутора или деревни.