Фамилия Наумочкин образована от крестильного мужского имени Наум, которое в переводе с древнееврейского означает «утешающий». В основе лежит уменьшительная форма Наумочка — так в быту могли звать человека, носившего полное церковное имя. Потомок того, кого домашние и соседи звали Наумочкой, со временем и получил фамилию Наумочкин.

Покровителем имени считается древнееврейский пророк Наум, предсказавший гибель Ниневии и написавший книгу об истории современной ему Палестины и древней Ассирии. На Руси имя было распространено среди всех сословий, поэтому фамилия встречается в разных регионах, но чаще — в центральных и северных областях, где крестильные имена давали в полной форме, а дома использовали ласковые производные.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -к- в основе Наумочка указывает на уменьшительно-ласкательное значение, а фамильный суффикс -ин присоединяется к основе, оканчивающейся на гласный. Такой тип типичен для русских фамилий, образованных от кратких или ласкательных форм имён: сравните с Ивашкин, Петрушкин, Ванечкин. Фамилия Наумочкин — не самая частотная, но и не редкая: она встречается в документах с XIX века, преимущественно в крестьянской и мещанской среде.

Интересная деталь: в некоторых говорах форма Наумочка могла закрепиться не только как ласкательное обращение, но и как самостоятельное обиходное имя, особенно в семьях, где имя Наум давали в честь деда или прадеда. Тогда фамилия фиксировала не просто уменьшительное, а родовое прозвище, переходящее из поколения в поколение. Впрочем, основная версия остаётся прежней: Наумочкин — это «сын Наумочки», то есть потомок человека, носившего ласковую форму имени Наум.