Фамилия Назифуллин — типичный пример тюрко-арабского именослова, прижившегося в русской среде. Её основа — мужское личное имя Назифулла, что в переводе с арабского означает «чистый, непорочный раб Аллаха» (назиф — чистый, улла — Аллах). К имени добавился русский патронимический суффикс -ин, который в Поволжье и на Урале часто заменял татарский вариант -ов, особенно в фамилиях, образованных от имён с окончанием на согласный или -а.

Фамилия почти наверняка сформировалась у волго-уральских татар или башкир, где традиция давать сложносоставные имена с компонентом «улла» (Габдулла, Абдулла, Назифулла) была распространена. В православной среде такие фамилии встречаются редко — носители, скорее всего, происходят из семей, сохранивших исламские корни. Суффикс -ин вместо -ов указывает на то, что фамилия могла закрепиться в документах конца XIX века, когда русские чиновники адаптировали татарские патронимы по аналогии с русскими фамилиями на -ин (Ильин, Пушкин).

Интересная деталь: в татарском языке имя Назифулла нередко давали в честь деда или религиозного авторитета, подчёркивая стремление к духовной чистоте. Это не прозвище по занятию или внешности, а именование по личному качеству, которое родители хотели видеть в сыне. Встречаются варианты написания Назифуллин и реже Назифулин (с одной «л»), но второй вариант — скорее результат упрощения в паспортных записях.

Среди носителей фамилии нет громких исторических фигур, известных за пределами региона. Это объяснимо: фамилия оставалась в основном в крестьянской и мещанской среде, не попав в дворянские родословные книги. Если искать корни, стоит обратить внимание на деревни бывшей Казанской или Уфимской губернии — там фамилия встречается чаще всего.