Фамилия Небайкин — самобытный памятник славянской культуры, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Небайка. В основе лежит глагол «байкать» с отрицательной частицей не-. В старину это слово означало «говорить, болтать, беседовать, рассказывать», поэтому прозвище Небайка могли дать человеку молчаливому, неразговорчивому и тихому. Такой человек не любил пустых разговоров, и окружающие быстро подмечали эту черту, закрепляя её в качестве именования.

Существует и вторая, не менее любопытная гипотеза. Слово «бай» в некоторых говорах обозначало компонент колыбельной песни — то самое «баю-бай», которым укачивают ребёнка. Тогда прозвище Небайка могло относиться к капризному, неугомонному малышу, которого сложно успокоить. Эта версия объясняет, почему прозвище могло закрепиться за человеком с детства и остаться с ним на всю жизнь. Обе трактовки укладываются в логику народной ономастики, но первая — с молчаливостью — выглядит правдоподобнее: прозвища взрослым людям чаще давали по устойчивым чертам характера, а не по детским капризам.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Небайкин — это «сын Небайки», потомок человека с таким прозвищем. Модель образования типична для русских фамилий, сформировавшихся в XVI–XVII веках, когда прозвища отцов переходили к детям и внукам. Интересно, что фамилия сохранила архаичную основу: сам глагол «байкать» сегодня почти вышел из употребления, но оставил след в однокоренных словах — «баюкать», «байка» (в значении «побасенка»), а также в фамилиях Байкин, Байков, Небаев.

Фамилия встречается в исторических документах. В Книге памяти Астраханской области упомянут Небайкин Ефим Алексеевич, родившийся в 1879 году в селе Владимировка. Это свидетельствует о бытовании фамилии в низовьях Волги, хотя её корни, вероятно, уходят в центральные или южнорусские губернии, где диалектное слово «байкать» было распространено шире.

Процесс формирования фамилии мог быть длительным, и привязка к одной местности не всегда обязательна. Точное время и место её возникновения можно установить лишь путём серьёзных генеалогических изысканий, но уже сейчас ясно: фамилия Небайкин — редкий пример того, как отрицание в прозвище описывало не отсутствие качества, а его ярко выраженную противоположность.