Фамилия Недомолкин звучит так, будто предок её носителя что-то не доделал. И это близко к истине: в её основе лежит прозвище Недомолка, которое образовано от глагола «молоть» — то есть растирать зерно в муку с помощью жерновов. Приставка «недо-» здесь указывает на неполноту действия, а значит, прозвище носило оттенок оценки: так могли назвать либо нерадивого мельника, который работал спустя рукава, либо, что вероятнее, неумелого ученика мельника, у которого зерно выходило недомолотым, а мука — грубой.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русских родовых именований. К прозвищу Недомолка добавили суффикс притяжательного прилагательного -ин, который отвечает на вопрос «чей?». Получилось «Недомолкин» — то есть сын, внук или потомок человека по прозвищу Недомолка. Такая модель встречается сплошь и рядом: если основа оканчивается на -а или -я, фамилию образуют именно с помощью -ин, а не -ов.

Интересно, что фамилия сохранила в себе глагольный корень с приставкой, что делает её «говорящей». В старину прозвища, связанные с ремеслом, часто давали по характерной ошибке или особенности работы. Недомолка — это не просто «мельник», а мельник с изъяном, тот, чью работу можно было узнать по плохому помолу. Возможно, прозвище закрепилось за человеком иронично, как это часто бывало в крестьянской среде, где ценили мастерство и трудолюбие, а нерадивость высмеивали.

Впрочем, есть и другая, менее очевидная версия. Глагол «молоть» в переносном смысле означал «говорить вздор, пустословить». В этом случае Недомолкой могли прозвать болтуна, который не договаривает мысль до конца, «недомалывает» её. Эта версия менее правдоподобна для основы фамилии, но полностью исключать её нельзя: в русских говорах подобные переносы значений встречались часто.

Сам по себе корень «мол-» широко представлен в русских фамилиях: Молотков, Мельников, Молчанов — но Недомолкин стоит особняком благодаря редкой приставке. Она не просто уточняет действие, а придаёт фамилии оттенок недосказанности, который и делает её такой узнаваемой.

Потомки Недомолки со временем унаследовали прозвище как родовое имя. Сословие носителей, скорее всего, было крестьянским или посадским: прозвища, связанные с ремеслом и бытом, чаще всего закреплялись именно в этих средах. Дворянские фамилии обычно образовывались от более «благородных» основ, а здесь мы видим живую, бытовую характеристику человека.