Фамилия Нефагин образована от прозвища Нефага, и это не просто личное имя, а оберег, призванный защитить ребенка от злой судьбы. В основе прозвища лежит тверское диалектное слово «невага» — «несчастье, невзгода». Чередование согласных в/ф здесь не случайность, а результат живых фонетических процессов в говорах, где губной звук [в] в определенных позициях оглушался до [ф]. Так «невага» превратилось в «нефага».

Вряд ли прозвище Нефага давали человеку с тяжелой судьбой — такое объяснение лежит на поверхности, но противоречит народной логике. Скорее, имя работало как охранительный оберег. Называя сына Нефагой, родители словно «откупались» от беды: считалось, что злые силы не тронут того, кого уже нарекли несчастным. Эта древняя магия имени — попытка обмануть судьбу, пожелать через отрицание прямо противоположного: счастья, удачи и благополучия.

Словообразовательная модель проста и типична для русских фамилий: к основе прозвища Нефага добавился патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Потомок человека по прозвищу Нефага становился Нефагиным — «сыном Нефаги». Фамилия закрепилась за родом и со временем утратила связь с исходным прозвищем.

Интересно, что фамилия сохранила редкую фонетическую форму. В письменных источниках чаще встречаются варианты с сохранением «в» — Невагин, которые могли возникнуть независимо в других регионах. Нефагин же — это отпечаток именно тверского произношения, что делает фамилию ценным свидетельством диалектной истории. Подобные примеры оглушения согласных в прозвищах не редкость, но в фамилиях они закрепляются редко, что придает Нефагину особую колоритность.

Фамилия бытует преимущественно в центральных областях России, что косвенно подтверждает ее северно-русское или тверское происхождение. О точной географии расселения носителей говорить сложно — данные разрозненны, но сам факт сохранения диалектной черты в фамилии говорит о глубоких корнях рода.