Фамилия Негмедзянова — редкий пример того, как тюркское имя, пройдя через русскую словообразовательную модель, превратилось в фамилию с неочевидным для русского уха корнем. В основе лежит мужское имя Негмедзин (или Негмеджан), которое восходит к арабскому «Нигмат» (نعمة) — «благо», «милость», «дар». Вторая часть — «джан» (персидское جان — «душа»). Вместе имя означает что-то вроде «душа-благодать» или «милостивая душа». Форма Негмедзянова — это притяжательное прилагательное с суффиксом -ов, адаптированное под женский род: буквально «из рода Негмедзяна».

Суффикс -ов (в женском варианте -ова) — стандартный русский способ оформления фамилий, который в XIX–XX веках «перекрывал» исходные тюркские формы. Мужской вариант фамилии — Негмедзянов. Интересно, что в татарской и башкирской среде ударение часто падает на последний слог: Негмедзяно́ва, хотя в русском произношении допустимо ударение на «я». Сама фамилия почти не встречается за пределами Поволжья и Приуралья — это верный признак того, что предки носителя были выходцами из татарских или башкирских родов, возможно, из числа служилых татар или крестьян, принявших православие и получивших фамилию по отцу.

В отличие от фамилий на -ин или -ский, Негмедзянова не связана с географическим названием или прозвищем по ремеслу. Это чисто патронимическая модель: фамилия закрепилась за потомками человека, которого в документах записали как Негмедзяна (или Негмедзина). Встречается также вариант Ногмедзянова — с «о» в первом слоге, что может быть следствием акающего произношения или описки писаря. Родственные фамилии — Негматов, Негматуллин, Нигматуллин — построены на том же корне, но с разными аффиксами.

По сословной принадлежности определённо сказать сложно: фамилия могла возникнуть и у крестьян, и у мещан, и у духовенства. Но сам факт, что она не получила широкого распространения и не «обрусела» до формы вроде Негмедов, говорит о поздней фиксации — скорее всего, в конце XIX века, когда переписчики уже не переделывали иноязычные имена на русский лад, а записывали их максимально близко к произношению.