Фамилия Негоша — редкий случай, когда за основу взято не имя, не профессия и не географическое название, а, скорее всего, местное прозвище, связанное с характером или внешностью. В этом её главная загадка.

Корень «негош» сближают с диалектным глаголом «негошить» — в некоторых южнорусских и украинских говорах это значило «нежиться», «баловать», «ласкать». Соответственно, Негошей могли прозвать человека изнеженного, капризного или, наоборот, того, кто сам любил холить и лелеять близких. Вторая, менее вероятная версия, выводит фамилию из сербской или черногорской ойконимии: существует село Негош, от которого пошла династия Негошей, правившая Черногорией. Но для русской фамилии такое заимствование маловероятно — скорее всего, это случайное совпадение, а не родство.

Суффикс -а, а не типичные -ов или -ин, указывает на то, что перед нами не патроним (сын Негоша), а, возможно, украинская или белорусская форма. В этих языках фамилии на -а часто закрепляли прозвища в неизменном виде, без добавления «чей сын». Поэтому предок носителя фамилии почти наверняка был выходцем с запада или юга России, из зоны украинского влияния, где прозвище «Негоша» прилепилось к нему самому, а не к его отцу.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В современных справочниках она практически не фиксируется, а единичные носители живут в основном в центральных и южных областях России. Это не фамилия знатного рода (за исключением упомянутой черногорской династии, которая к русским Негошам отношения не имеет), а скорее редкое свидетельство того, как местное слово, описывающее манеру поведения, превратилось в родовое имя.