Фамилия Некляев происходит от личного прозвища Некляй и укладывается в распространённую модель русских фамилий на -ев, образованных от основ, оканчивающихся на й. Но за этим простым словообразованием скрывается неожиданный смысловой поворот: прозвище, скорее всего, давали человеку не за его пороки, а за их отсутствие.

Первую и самую правдоподобную версию связываем с глаголом «клясть» — проклинать, ругать, желать зла. Некляем могли прозвать того, кто этим никогда не занимался: добродушного, незлопамятного человека, с которым легко ужиться. Отрицательная приставка не- здесь работает наоборот — не фиксирует недостаток, а подчёркивает его отсутствие, что для прозвищ редкость.

Вторая версия опирается на тверской диалектный глагол «клямиться» — трудиться, маяться, работать. Тогда Некляй — человек, не склонный к труду, и фамилия приобретает уже ироничный оттенок. Обе гипотезы имеют право на жизнь, но первая выглядит убедительнее: она опирается на общерусский глагол, тогда как вторая завязана на узкий местный говор.

Существует и третья, менее вероятная гипотеза — топонимическая. В Польше, в Великопольском воеводстве, есть город Некля, и основатель рода теоретически мог быть его уроженцем. Но для крестьянской Руси такая версия выглядит натянутой: массового переселения из этого небольшого города не было, а прозвищная традиция даёт более естественное объяснение.

О точном времени и месте возникновения фамилии говорить сложно — процесс становления русских фамилий растянулся на столетия. Ясно одно: потомок человека по прозвищу Некляй со временем стал писаться Некляевым, и эта фамилия — памятник живой народной речи, где отрицание «не» могло превратиться в ласковую характеристику человека.