Фамилия Некомкин — редкий пример, где суффикс -ин намеренно привлекает внимание. В русской модели -ин обычно крепится к основе на -а/-я (сын Пушки — Пушкин), а Некомкин звучит так, будто исходное прозвище было Некомка. Но если присмотреться, это почти наверняка искажение или диалектное произношение от Некомов (с суффиксом -ов), где конечный -ов под влиянием живого говора превратился в -кин. Такое явление встречается в северных и сибирских говорах, где фамилии на -ов нередко переделывали в -ин, чтобы звучало «по-свойски».

Основа фамилии — некомый, то есть «тот, кого не комают». В старых русских диалектах комать означало «мять, тискать, сжимать», а в переносном смысле — «обижать, притеснять». Некомый человек — неприкасаемый, которого не трогают, не задевают. Прозвище Некома (или Некомка) могли дать либо спокойному, мирному парню, с которым никто не ссорился, либо, наоборот, человеку, который сам никого не обижал и жил тихо. Есть и другая версия: комать в некоторых говорах значило «резать, крошить» (например, капусту), так что некомый — «нерезаный», то есть цельный, крепкий. Но первое значение — про избегание ссор — выглядит убедительнее для прозвища.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье и на Урале. В дореволюционных переписях её почти нет, что говорит о позднем закреплении: возможно, фамилию дали в духовной среде или в среде однодворцев, где ценились необычные прозвища. По сословной принадлежности предки Некомкиных скорее всего были государственными крестьянами или мещанами — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Некомов, Некомовцев, Комаров — показывает, что Некомкин стоит особняком. Если Комаров ведёт начало от комара (насекомого), то Некомкин — от глагола, что делает её более «говорящей» и личной. Сегодня носителей фамилии немного, но каждый из них — хранитель редкого диалектного слова, которое почти исчезло из речи.