Фамилия Непёкин — редкий случай, когда прозвище человека, скорее всего, было образовано от глагола с отрицанием. Основа здесь — «печь», но не в смысле готовить еду, а в значении «жарить, палить, припекать» (солнце печёт, печка печёт). Приставка «не-» в русских фамилиях обычно указывает на человека, который не делал того, что делали другие, или которого прозвали по отсутствию какого-то качества.

Модель образования проста: прозвище Непёка (тот, кто не печёт, не жжёт, не палит) плюс суффикс принадлежности -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях означает «чей?» — сын Непёки, потомок Непёки. Встречаются и однокоренные фамилии: Непёков (с суффиксом -ов, что реже для прозвищ на -а), Печёнов, Печёнкин.

Что могло означать прозвище Непёка? Самая вероятная версия — ремесленная. В среде пекарей или кузнецов (где «печь» — ключевой процесс) человека, который работал медленно, неаккуратно или вовсе не занимался своим делом, могли иронично назвать Непёкой. Вторая версия — метеорологическая или бытовая: так могли прозвать бледного, не загорающего на солнце человека или того, кто не топил печь в доме (холодный, нерадивый хозяин). Третья, более редкая, — связь с диалектным словом «пёк» (жар, зной). Непёка — тот, кто не выносит жары.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, где слово «печь» в значении «палить» было особенно употребительно. Встречается она нечасто, что естественно для фамилий с отрицательной приставкой — такие прозвища давали реже, чем «положительные» (типа Пекарь или Пекун). Сословно носители Непёкины — почти наверняка крестьяне или ремесленники, поскольку прозвище родилось в среде, где «печение» было повседневным трудом. В дворянской среде подобных фамилий практически не бывает.

Споров о происхождении немного: ясно, что это не от имени (Непёка не похоже на крестильное имя), а от прозвища. Единственный сомнительный вариант — связь с фамилией Непейвода (пить), но там другая приставка и другая семантика. Непёкин — фамилия, которая прямо указывает на занятие или характер предка, и в этом её ценность для исследователя.