Фамилия Неподоба — редкий случай, когда прозвище стало фамилией почти без изменений, без патронимических суффиксов -ов или -ин. В русской ономастике такие «голые» формы обычно указывают на украинское, белорусское или южнорусское происхождение, где фамилии нередко застывали в виде именительного падежа. В основе лежит слово «неподоба» — в старых говорах так называли нечто неподобающее, неприличное, не соответствующее нормам поведения или внешнего вида.

Скорее всего, прозвище Неподоба дали человеку с нестандартным, вызывающим поведением — либо тому, кто нарушал общественные приличия, либо, напротив, кому окружающие приписывали такую характеристику иронически. В крестьянской среде подобные прозвища не несли прямой уголовной окраски, а скорее фиксировали заметную черту: неловкость, грубость, чудачество. Возможна и вторая, менее вероятная версия: Неподоба могло быть охранительным именем — родители нарекали ребёнка «нехорошим» словом, чтобы отвести от него сглаз и злые силы.

Отсутствие типичного фамильного суффикса говорит о том, что фамилия закрепилась в устной традиции, а не через письменные документы. В переписях и ревизских сказках такую форму могли записать как Неподоба без изменений, особенно если носитель жил на территориях, где польское или малороссийское влияние ослабляло московскую модель фамилеобразования. Сравните с однокоренными фамилиями Неподобный, Неподобов — они встречаются чаще и образованы по стандартной схеме.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям. В современных базах Неподоба встречается эпизодически, преимущественно на юге России и в Беларуси. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это стопроцентно крестьянское или казачье прозвище, которое не попало в гербовники.