Фамилия Непогода звучит как прозвище, и это самый вероятный путь её возникновения. В основе лежит нарицательное слово «непогода» — дождь, снег, метель или буря. Такое мирское имя могли дать ребёнку, родившемуся в разгул стихии, когда за окном выло и завывало. Но у этого имени есть и вторая, более глубокая функция — обереговая. Называя желанного и любимого ребёнка Непогодой, родители словно обманывали злые силы: мол, ничего ценного в этой семье нет, обычное ненастье. Считалось, что после такого «обмана» судьба будет к человеку благосклонна и подарит ему жизнь безоблачную и счастливую, в противовес мрачному имени.

Словообразовательная модель здесь проста: фамилия совпадает с основой мирского имени без добавления типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это характерно для прозвищ, которые закрепились в качестве фамилий в неизменном виде, особенно в украинской, белорусской и южнорусской традициях. Поэтому Непогода — это фамилия, которая буквально законсервировала древнее имя-оберег.

Существует и менее распространённая гипотеза, которая связывает прозвище с глаголом «погодить», то есть «подождать, повременить». С частицей «не» это давало бы значение «не терпящий ожидания», «нетерпеливый» или, наоборот, «непоседливый». Согласно этой версии, прозвище отражало бы черты характера предка — поспешность или порывистость. Однако эта трактовка выглядит надуманной: гораздо естественнее объяснять фамилию через прямое значение слова, которое понятно каждому носителю языка. Связь с атмосферными явлениями — первична, а характерологическая версия — лишь вторичное переосмысление.

Интересно, что фамилия сохранила ударение на последнем слоге, как и само слово, что тоже указывает на её прозвищное, а не книжное происхождение. Встречается она преимущественно там, где сильны традиции прозвищных фамилий — на Украине и в южных областях России. Носители фамилии могут считать себя потомками человека, которого в давние времена либо застала непогода в важный момент, либо нарекли так в минуту рождения, либо намеренно дали ему имя-оберег, чтобы отвести беду.