Фамилия Нецоко — редкая и неочевидная с точки зрения русского словообразования. Её форма не вписывается в типичные модели на -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, пришедшая с Кавказа или из тюркоязычной среды, где она могла быть зафиксирована на письме в русифицированном виде.

Самая вероятная версия связывает Нецоко с адыгскими (черкесскими) фамилиями. В адыгском языке распространены фамилии, оканчивающиеся на -ко (например, Шхалахо, Тхагапсо, Хакурате). Компонент -ко означает «сын» или «потомок». Первая часть — Нецо — может восходить к личному имени или прозвищу. В адыгской ономастике встречаются имена с корнем «не» (нэ — глаз, зрение) или «нец» (сравните с адыгским «нэцӏыкӏу» — маленький глаз, зоркий). Таким образом, Нецоко можно перевести как «сын Зоркого» или «потомок того, у кого маленькие глаза». Прозвища по внешним признакам — частая основа для фамилий у горских народов.

Менее убедительная версия — тюркская. В некоторых тюркских языках «нец» или «нез» может означать «слабый», «худой», а суффикс -ок часто встречается в уменьшительных формах. Но тогда фамилия должна была бы звучать иначе и иметь другую географию. Основной ареал фамилии Нецоко — Краснодарский край, Адыгея и Кабардино-Балкария. Это подтверждает адыгскую версию, так как именно там исторически жили черкесские народы.

В России фамилия могла быть записана при переписях или в метрических книгах с искажением. Адыгские фамилии часто адаптировали на слух, отсекая гортанные звуки и меняя окончания. Например, полная адыгская форма могла звучать как Нецокъо или Нецокӏу, а русский писарь зафиксировал её как Нецоко, убрав специфический щёлкающий звук. Поэтому не стоит удивляться, что в разных документах XIX — начала XX века одну семью могли записывать по-разному: Нецоков, Нецоковский и, наконец, Нецоко.

Сословный состав у носителей фамилии был пёстрым. Среди адыгов фамилию могли носить как уздени (дворяне), так и свободные крестьяне. При переселении в Российскую империю после Кавказской войны многие черкесы получали паспорта с русифицированной фамилией и приписывались к казачьим или крестьянским сословиям. Сейчас Нецоко — фамилия малочисленная, её носители живут в основном на юге России, и встретить её за пределами Кавказа почти невозможно.